La chapelle des Pénitents noirs est une chapelle située à Aubagne, dans le département des Bouches-du-Rhône, en France. Elle fait l’objet d’une inscription au titre des monuments historiques depuis le 2 décembre 1927.

La confrérie des Pénitents Noirs fut fondée en 1551. L'actuel bâtiment a évolué entre 1627 et 1728. En 1784, il a été doté d'une façade néo-classique inspirée du Panthéon de Rome. Il a été construit à l'emplacement d'une chapelle Saint-Michel, dont on suppose la construction postérieure au démembrement de la Cité d'Arles qui eut lieu dans le courant du Ve siècle. Elle fût desservie par les moines de l'abbaye de Saint Victor jusqu'au XIIe siècle. En 1793, la chapelle des Pénitents servit d'étable pour les animaux destinés au ravitaillement des troupes du siège de Toulon. Le 22 octobre 2008 la Chapelle des Pénitents Noirs reçoit le prix départemental des Rubans du Patrimoine pour sa restauration exemplaire. Ce monument est désormais une salle d'exposition.